從實驗室工作流程來看，微生物實驗室可分為樣品保存、樣品前處理、過程分析、清洗滅菌四個流程，不同的工作流程需要不同的儀器。

一、樣品保存
1、 超低溫冰箱：低溫保存疫苗、菌種、生物樣本等
2、 液氮罐：長期活性保存疫苗、菌毒種、細胞
3、 藥品冷藏箱：用于冷藏保存藥品、試劑、生物制品和疫苗
二、樣品前處理
1、 移液器：定量轉(zhuǎn)移液體的器具
2、 離心機: 液固或液液顆粒分離
3、 凍干機: 凍結的水分子直接升華水蒸氣
4、 均質(zhì)儀: 提取樣品中DNA/RNA/蛋白質(zhì)
5、 培養(yǎng)箱: 培養(yǎng)微生物、植物和動物細胞
6、 生物安全柜: 實驗操作中空氣凈化負壓安全裝置
7、 超凈工作臺: 局部工作區(qū)域潔凈度

三、過程分析
1、 PCR儀：用于傳染病的診斷、基因復制以及親子鑒定
2、 酶標儀：酶聯(lián)免疫吸附試驗的專用儀器
3、 核酸提取儀：核酸提取試劑自動完成樣本核酸提取
4、 暗箱式紫外分析儀：于核酸、蛋白電泳凝膠，薄層層板結果的觀察分析
5、 電泳儀：用于DNA 測序
四、清洗滅菌
1、 高壓滅菌鍋：實驗前后殺菌
2、超聲波清洗機：清洗實驗器具及玻璃器皿
使用微生物檢測儀的檢測方法就比較簡單了。

1、開機預熱，30秒后即進入工作狀態(tài)；

2、將一體化試劑采樣棉簽棒從超凈管中拔出準備采樣；

3、對被測物進行采樣；

4、采樣完后放進超凈管中旋緊密封；

5、按壓一體化試劑棒頂部使密封腔內(nèi)試劑自動流入超凈管中與棉簽棒上標本發(fā)生ATP反應；

6、按壓儀器頂部橙黃色按鈕使試劑艙蓋自動彈開；

7、將正在發(fā)生反應的一體化試劑插入儀器試劑艙接受檢測；

8、經(jīng)過十幾秒檢測時間儀器完成標本檢測，自動顯示、存儲、傳輸ATP檢測結果。